平台组织框架
作为建设运行的牵头单位，南京医科大学整体承担技术攻关、人才培养和学科建设的主体责任，建立3个委员会为核心及下设“3部1院1室”的管理组织架构。
管委会是创新平台的决策和监督机构，主任由南京医科大学党委书记兰青担任，成员由学校和主要共建单位负责人共同组成。负责平台重大事项的决策、重大政策的制定、重要人员的选聘等，从发展方向、战略目标、机构设置、预算决算等方面为平台制定相关制度和运行机制，监督制度和运行机制的执行情况，支持与保障平台的运行。
学术委员会是创新平台的咨询机构，主任由南京医科大学校长胡志斌担任，成员由学校和共建单位专家组成。主要负责向平台提供有关咨询意见和建议，对平台的人才培养、科技创新、科技成果转化与产业化等方面进行指导。
执行委员会是创新平台的日常运转机构。创新平台实行主任负责制，主任由南京医科大学副校长夏彦恺担任，负责平台建设运行发展的全面工作，包括：技术攻关、人才培养、学科建设、制度体系构建、经费使用、绩效考核、对外合作联系等各类事项。同时，执行委员会下设平台办公室、人才培养部、学科建设部、产教融合部、创新研究院五个具体部门，即“3部1院1室”，分工协作推进平台建设与运行。同时，创新研究院负责对平台下设的4个中心相关工作进行扎口管理。
执行委员会成员：
主任：夏彦恺
副主任：王建明 苏 川 韩 峰 李靖欣 刘 勇 英 博 滕红刚
首席科学家：朱凤才
执行委员会下设部门：
学科建设部（负责人：王建明）
人才培养部（负责人：靳光付）
产教融合部（负责人：李靖欣）
执行委员会下设研究院：
创新研究院：下设4个分中心，包括：
基础研究中心（负责人：苏川）
临床前研究中心（负责人：韩峰）
临床试验中心（负责人：李靖欣）
上市后应用研究中心（负责人：王建明）
执行委员会下设办公室：
主任：黄鹏
成员：范贇、王立仪
